三方晶系，a0=0.313nm，c0=0.474nm；Z=1。水鎂石型結構為重要的層狀結構之一。結構中(OH)-近似作六方緊密堆積，Mg2 充填在堆積層相隔一層的八面體空隙中，每個Mg被6個OH包圍，每個OH一側有3個Mg。[Mg(OH)6]八面體∥{0001}以共棱方式聯(lián)結成層，層間以很弱的氫氧鍵相維系，形成層狀結構。Mg-OH不是正八面體片，沿c軸方向有明顯壓扁，片厚從正常的0.247nm變?yōu)?.211nm。水鎂石的結構特點使其具有板狀晶形、低硬度及∥{0001}的極完全解理。
復三方偏三角面體晶類，D3d-3m（L33L33PC）。晶體呈板狀或葉片狀。常見單形：平行雙面c{0001}，六方柱m{1120}，菱面體r{1011}、q{0113}或{2021}。晶體通常呈板狀、細鱗片狀、渾圓狀、不規(guī)則粒狀集合體；有時出現(xiàn)平行纖維狀集合體，稱為纖水鎂石。纖水鎂石內部存在結構畸變。